Klinički rad studenata, specijalizanata i doktoranata se obavlja na institutu za stomatologiju, koji čine šest klinika:
- Klinika za stomatološku protetiku,
- Klinika za bolesti zuba,
- Klinika za oralnu hirurgiju,
- Klinika za parodontologiju i oralnu medicinu,
- Klinika za preventivnu i dečju stomatologiju,
- Klinika za ortopediju vilica.
Sve klinike su kompletno opremljene najsavremenijom opremom svetski priznatih proizvođača.
U radu sa pacijentima se koriste najsavremeniji stomatološki materijali.
Rad na klinikama se odvija kroz sve potrebne faze saniranja pacijenata, od dijagnostike pa do ugradnje implantata i kompletnog protetskog zbrinjavanja uključujući metalnu i bezmetalnu keramiku.
Na Institutu za stomatologiju se svake godine primi i sanira oko 1600 pacijenata kroz sve vidove stomatološke zdravstvene zaštite.
Uvedena je klinička primena lasera u stomatologiji u svakodnevni rad.
Sastavni deo za dijagnostiku u kliničkom radu se koristi ortopan sa telerengenom i digitalni rengen.
Svi protetski radovi se rade u fakultetskoj laboratoriji za protetiku.